Back to mainSequenceSequence comparisonBLASTSearchDocumentation

Web-blast page


Enter sequence here:
Blast type:
Use filter: Yes No
E-value:

Genomes in the Database:

Metallosphaera sedula DSM 5348 Sulfolobus acidocaldarius Sulfolobus solfataricus P2
Sulfolobus tokodaii str. 7 All local organisms 

Viruses in the Database:

AFV1 AFV2
AFV3 AFV6
AFV7 AFV8
AFV9 ARV1
ATV SIFV
SIRV1 SIRV1-XX
SIRV2 SRV
SSV1 SSV2
SSV4 SSV5
SSVk1 SSVrh
STIV STSV1
All local viruses 

Plasmids in the database:

pAH1 pARN3 pARN4
pDL10 pHEN7 pHVE14
pING1 pIT3 pKEF9
pNOB8 pORA1 pRN1
pRN2 pSOG1 pSOG2
pSSVi pSSVx pTAU4
pTC pTIK4 pXZ1
All local plasmids  

Genomes from the NCBI database:

Archael genomes :

A. fulgidus DSM 4304 A. pernix K1 H. marismortui ATCC 43049
H. sp. NRC-1 M. acetivorans C2A M. barkeri str. fusaro
M. jannaschii DSM 2661 M. kandleri AV19 M. maripaludis S2
M. mazei Go1 M. thermautotrophicus str. Delta H N. equitans Kin4-M
N. pharaonis DSM 2160 P. abyssi GE5 P. aerophilum str. IM2
P. furiosus DSM 3638 P. horikoshii OT3 P. torridus DSM 9790
S. acidocaldarius DSM 639 S. solfataricus P2 S. tokodaii str. 7
T. acidophilum DSM 1728 T. kodakaraensis KOD1 T. volcanium GSS1
All archaea  

Bacterial genomes :

A. aeolicus VF5 A. marginale str. St. Maries A. sp. ADP1
A. sp. EbN1 A. tumefaciens str. C58 A. variabilis ATCC 29413
B. abortus biovar 1 str. 9-941 B. anthracis str. 'Ames Ancestor' B. anthracis str. Ames
B. anthracis str. Sterne B. aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) B. aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae)
B. aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum) B. bacteriovorus HD100 B. bronchiseptica RB50
B. burgdorferi B31 B. cereus ATCC 10987 B. cereus ATCC 14579
B. cereus E33L B. clausii KSM-K16 B. fragilis NCTC 9343
B. fragilis YCH46 B. garinii PBi B. halodurans C-125
B. henselae str. Houston-1 B. japonicum USDA 110 B. licheniformis ATCC 14580
B. longum NCC2705 B. mallei ATCC 23344 B. melitensis 16M
B. parapertussis 12822 B. pertussis Tohama I B. pseudomallei 1710b
B. pseudomallei K96243 B. quintana str. Toulouse B. sp. 383
B. subtilis subsp. subtilis str. 168 B. suis 1330 B. thetaiotaomicron VPI-5482
B. thuringiensis serovar konkukian str. 97-27 C. Blochmannia floridanus C. Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN
C. Pelagibacter ubique HTCC1062 C. abortus S26/3 C. acetobutylicum ATCC 824
C. burnetii RSA 493 C. caviae GPIC C. chlorochromatii CaD3
C. crescentus CB15 C. diphtheriae NCTC 13129 C. efficiens YS-314
C. glutamicum ATCC 13032 C. hydrogenoformans Z-2901 C. jeikeium K411
C. jejuni RM1221 C. jejuni subsp. jejuni NCTC 11168 C. muridarum Nigg
C. perfringens str. 13 C. pneumoniae AR39 C. pneumoniae CWL029
C. pneumoniae J138 C. pneumoniae TW-183 C. psychrerythraea 34H
C. tepidum TLS C. tetani E88 C. trachomatis A/HAR-13
C. trachomatis D/UW-3/CX C. violaceum ATCC 12472 D. aromatica RCB
D. desulfuricans G20 D. ethenogenes 195 D. psychrophila LSv54
D. radiodurans R1 D. sp. CBDB1 D. vulgaris subsp. vulgaris str. Hildenborough
E. canis str. Jake E. carotovora subsp. atroseptica SCRI1043 E. coli CFT073
E. coli K12 E. coli O157:H7 E. coli O157:H7 EDL933
E. faecalis V583 E. ruminantium str. Gardel E. ruminantium str. Welgevonden
F. nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586 F. tularensis subsp. tularensis SCHU S4 G. kaustophilus HTA426
G. metallireducens GS-15 G. oxydans 621H G. sulfurreducens PCA
G. violaceus PCC 7421 H. ducreyi 35000HP H. hepaticus ATCC 51449
H. influenzae 86-028NP H. influenzae Rd KW20 H. pylori 26695
H. pylori J99 I. loihiensis L2TR L. acidophilus NCFM
L. innocua Clip11262 L. interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 L. interrogans serovar Lai str. 56601
L. johnsonii NCC 533 L. lactis subsp. lactis Il1403 L. monocytogenes EGD-e
L. monocytogenes str. 4b F2365 L. plantarum WCFS1 L. pneumophila str. Lens
L. pneumophila str. Paris L. pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 L. xyli subsp. xyli str. CTCB07
M. avium subsp. paratuberculosis K-10 M. bovis AF2122/97 M. capsulatus str. Bath
M. florum L1 M. gallisepticum R M. genitalium G37
M. hyopneumoniae 232 M. hyopneumoniae 7448 M. hyopneumoniae J
M. leprae TN M. loti MAFF303099 M. mobile 163K
M. mycoides subsp. mycoides SC str. PG1 M. penetrans HF-2 M. pneumoniae M129
M. pulmonis UAB CTIP M. succiniciproducens MBEL55E M. synoviae 53
M. tuberculosis CDC1551 M. tuberculosis H37Rv N. europaea ATCC 19718
N. farcinica IFM 10152 N. gonorrhoeae FA 1090 N. meningitidis MC58
N. meningitidis Z2491 N. oceani ATCC 19707 N. sp. PCC 7120
N. winogradskyi Nb-255 O. iheyensis HTE831 O. yellows phytoplasma OY-M
P. acnes KPA171202 P. aeruginosa PAO1 P. arcticus 273-4
P. carbinolicus DSM 2380 P. fluorescens Pf-5 P. fluorescens PfO-1
P. gingivalis W83 P. haloplanktis TAC125 P. luminescens subsp. laumondii TTO1
P. luteolum DSM 273 P. marinus str. MIT 9312 P. marinus str. MIT 9313
P. marinus str. NATL2A P. marinus subsp. marinus str. CCMP1375 P. marinus subsp. pastoris str. CCMP1986
P. multocida subsp. multocida str. Pm70 P. profundum SS9 P. putida KT2440
P. sp. UWE25 P. syringae pv. phaseolicola 1448A P. syringae pv. syringae B728a
P. syringae pv. tomato str. DC3000 R. baltica SH 1 R. conorii str. Malish 7
R. eutropha JMP134 R. felis URRWXCal2 R. palustris CGA009
R. prowazekii str. Madrid E R. solanacearum GMI1000 R. sphaeroides 2.4.1
R. typhi str. Wilmington S. agalactiae 2603V/R S. agalactiae A909
S. agalactiae NEM316 S. aureus subsp. aureus COL S. aureus subsp. aureus MRSA252
S. aureus subsp. aureus MSSA476 S. aureus subsp. aureus MW2 S. aureus subsp. aureus Mu50
S. aureus subsp. aureus N315 S. avermitilis MA-4680 S. coelicolor A3(2)
S. elongatus PCC 6301 S. enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis S. enterica subsp. enterica serovar Typhi Ty2
S. enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18 S. epidermidis ATCC 12228 S. epidermidis RP62A
S. flexneri 2a str. 2457T S. flexneri 2a str. 301 S. haemolyticus JCSC1435
S. meliloti 1021 S. mutans UA159 S. oneidensis MR-1
S. pneumoniae R6 S. pneumoniae TIGR4 S. pomeroyi DSS-3
S. pyogenes M1 GAS S. pyogenes MGAS10394 S. pyogenes MGAS315
S. pyogenes MGAS5005 S. pyogenes MGAS6180 S. pyogenes MGAS8232
S. pyogenes SSI-1 S. saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 S. sonnei Ss046
S. sp. CC9605 S. sp. CC9902 S. sp. PCC 6803
S. sp. WH 8102 S. thermophilum IAM 14863 S. thermophilus CNRZ1066
S. thermophilus LMG 18311 S. typhimurium LT2 T. crunogena XCL-2
T. denitrificans ATCC 25259 T. denitrificans ATCC 33889 T. denticola ATCC 35405
T. elongatus BP-1 T. fusca YX T. maritima MSB8
T. pallidum subsp. pallidum str. Nichols T. tengcongensis MB4 T. thermophilus HB27
T. thermophilus HB8 T. whipplei TW08/27 T. whipplei str. Twist
U. parvum serovar 3 str. ATCC 700970 V. cholerae O1 biovar eltor str. N16961 V. fischeri ES114
V. parahaemolyticus RIMD 2210633 V. vulnificus CMCP6 V. vulnificus YJ016
W. endosymbiont of Drosophila melanogaster W. endosymbiont strain TRS of Brugia malayi W. glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis
W. succinogenes DSM 1740 X. axonopodis pv. citri str. 306 X. campestris pv. campestris str. 8004
X. campestris pv. campestris str. ATCC 33913 X. campestris pv. vesicatoria str. 85-10 X. fastidiosa 9a5c
X. fastidiosa Temecula1 X. oryzae pv. oryzae KACC10331 Y. pestis CO92
Y. pestis KIM Y. pestis biovar Medievalis str. 91001 Y. pseudotuberculosis IP 32953
Z. mobilis subsp. mobilis ZM4 All bacteria 
Kim Brugger